La Universidad del Istmo, UNISTMO, inició sus actividades académicas en junio del año 2002, con la apertura de sus campus Tehuantepec e Ixtepec en la región del Istmo, del Estado de Oaxaca.
Fue inaugurada el 22 de Febrero de 2002 con la presencia del Gobernador del estado Lic. Jose Murat Casab, incrementando así el número de universidades estatales de Oaxaca.
La Universidad del Istmo se rige por las disposiciones emanadas del Poder Legislativo del Estado mediante decreto publicado en el Periódico Oficial el 18 de junio del 2002. Se caracteriza por ser un proyecto en las primeras fases de crecimiento y consolidación. El modelo pretende ser instrumento y catalizador de las transformaciones regionales, para tales fines cuenta con profesores de tiempo completo, cuyas funciones básicas son docencia, investigación, difusión de la cultura y la promoción del desarrollo regional, de ellos, el 95 % cuenta con grado de maestría, el resto de doctorado.
A nivel regional somos la mejor oferta educativa, no sólo por el alto nivel de nuestros recursos humanos, sino también, por las características de los espacios físicos en los que nos desarrollamos. Actualmente, los tres campus de la UNISTMO, Tehuantepec, Ixtepec y Juchitán respectivamente, cuentan con instalaciones únicas en la zona, que proveen a la comunidad universitaria de lo indispensable para llevar a cabo su preparación académica en las mejores condiciones posibles, y seguimos creciendo, con la finalidad de ofrecer cada día mejores servicios.